Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAT1Q99536 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAT1Q99536 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms