Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TCF12Q99081 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF12Q99081 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms