Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCZQ96LD1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCZQ96LD1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms