Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKD1Q969G9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms