Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIEQ8NEW7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms