Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGSF1Q8N6C5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms