Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF554Q86TJ5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms