Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APTXQ7Z2E3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms