Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PHYHD1Q5SRE7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms