Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NTRK2Q16620 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms