Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CTF1Q16619 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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CTF1Q16619 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CTF1Q16619 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CTF1Q16619 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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CTF1Q16619 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CTF1Q16619 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CTF1Q16619 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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