Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EXT1Q16394 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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EXT1Q16394 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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EXT1Q16394 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EXT1Q16394 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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