Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM29Q14134 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM29Q14134 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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