Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK13Q14004 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK13Q14004 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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