Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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PKP1Q13835 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PKP1Q13835 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PKP1Q13835 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PKP1Q13835 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PKP1Q13835 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PKP1Q13835 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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