Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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ITGA9Q13797 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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ITGA9Q13797 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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ITGA9Q13797 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA9Q13797 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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