Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CACNA1SQ13698 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CACNA1SQ13698 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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