Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL3Q13618 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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