Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GOLGA4Q13439 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GOLGA4Q13439 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms