Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB40BQ12829 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RAB40BQ12829 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB40BQ12829 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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