Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMARCB1Q12824 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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