Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SRSF4Q08170 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms