Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NUCB1Q02818 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms