Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKOR1P84550 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms