Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HTRA4P83105 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms