Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRB1P82279 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRB1P82279 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRB1P82279 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRB1P82279 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms