Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RELNP78509 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RELNP78509 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RELNP78509 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms