Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA1P68133 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTA1P68133 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms