Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P62684 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms