Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCS1P62166 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NCS1P62166 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NCS1P62166 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms