Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NME5P56597 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NME5P56597 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NME5P56597 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms