Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP153P49790 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP153P49790 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NUP153P49790 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP153P49790 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms