Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCC1P33527 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms