Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFNP31947 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFNP31947 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFNP31947 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFNP31947 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms