Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPOP30536 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms