Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSMB9P28065 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms