Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCNA2P20248 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCNA2P20248 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms