Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GLI1P08151 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GLI1P08151 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GLI1P08151 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms