Protein–RNA interactions for Protein: P07954

FH, Fumarate hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHP07954 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FHP07954 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FHP07954 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FHP07954 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms