Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TBX18O95935 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TBX18O95935 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TBX18O95935 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TBX18O95935 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms