Protein–RNA interactions for Protein: O95170

CDRT1, CMT1A duplicated region transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT1O95170 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDRT1O95170 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms