Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2F6O75461 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F6O75461 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms