Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCL13O43927 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms