Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms