Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGSM2O43147 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGSM2O43147 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGSM2O43147 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGSM2O43147 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGSM2O43147 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SGSM2O43147 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms