Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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SNX13Q9Y5W8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX13Q9Y5W8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX13Q9Y5W8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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