Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATPIF1Q9UII2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms