Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APEX2Q9UBZ4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms