Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CENPMQ9NSP4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms