Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms